أ – ينعقد المؤتمر العام على هامش المؤتمر الطبي العربي السنوي عند الحاجة لإنعقاده لمباشرة اختصاصاته بقرار من رئيس المؤتمر.
ب – يختار المؤتمر العام رئيساً له على مدار دورة كاملة للاتحاد (خمس سنوات).
جـ – يختص المؤتمر العام بتعديل القانون الأساسي ولائحة الاتحاد– بناء على اقتراح من الأمانة العامة– ويشترط لذلك حضور ممثلي نصف الدول الأعضاء على الأقل وحضور ما لا يقل عن 300 طبيب عربي.